長崎ペンギン水族館自然体験ゾーンの植物目録です．草本層以外の植物は省略しました．
科以上の配列は，一般的な植物目録の順序によりました．種の配列は50音順としました．
帰化植物の定義は原則として“保育社刊【エコロジーガイド 日本の帰化植物】の巻末リストに掲載されている種”としました．帰化植物には＜＞をつけ，さらにスタイルシート有効のブラウザでは桃色表示されるようにしています．
アキノノゲシ・＜アメリカセンダングサ＞・＜アレチノギク＞・＜ウラジロチチコグサ＞・＜オオキンケイギク＞・オニタビラコ・カワラヨモギ・キツネアザミ・コセンダングサ・シマカンギク・シロバナタンポポ・＜セイタカアワダチソウ＞・＜セイヨウタンポポ＞・タカサブロウ・チチコグサ・＜チチコグサモドキ＞・ツワブキ・ノアザミ・＜ハキダメギク＞・ハハコグサ・ハルノノゲシ・＜ヒメジョオン＞・＜ヒメムカシヨモギ＞・＜マメカミツレ＞・ヨモギ・ヨメナ
＜キキョウソウ＞・サイヨウシャジン・ミゾカクシ
カラスウリ
スイカズラ
アカネ・ヘクソカズラ・ヤエムグラ
オオバコ
キツネノマゴ
＜オオイヌノフグリ＞・＜タチイヌノフグリ＞
＜アメリカイヌホオズキ＞・テリミノイヌホオズキ・ヒヨドリジョウゴ
アキノタムラソウ・イヌトウバナ・ウツボグサ・トウバナ・ハッカ・ホトケノザ・メハジキ・ヤマハッカ
クサギ・ムラサキシキブ
キュウリグサ・ハナイバナ
アサガオ・コヒルガオ・ヒルガオ・＜ルコウソウ＞
ガガイモ
コナスビ
ヤブコウジ
ヤマツツジ
セリ・ツボクサ・ノチドメ・＜マツバゼリ＞・ミツバ・ヤブジラミ
＜コマツヨイグサ＞・＜メマツヨイグサ＞
ヒシ
スミレ
エビヅル・ツタ・ノブドウ・ヤブガラシ
ツルウメモドキ
ヌルデ
アカメガシワ・エノキグサ・＜オオニシキソウ＞・＜チャボタイゲキ＞・＜ナンキンハゼ＞
カラスザンショウ・ハマセンダン
＜オッタチカタバミ＞・カタバミ・＜ムラサキカタバミ＞
＜アメリカフウロ＞・ゲンノショウコ
カスマグサ・カラスノエンドウ・カワラケツメイ・クズ・ゲンゲ・＜コメツブツメクサ＞・＜シロツメクサ＞・スズメノエンドウ・ツルマメ・ネコハギ・ネムノキ・メドハギ・ヤハズソウ
クサイチゴ・ナワシロイチゴ・ダイコンソウ・フユイチゴ・ヤマザクラ
マルバウツギ
メノマンネングサ
アブラナ・イヌガラシ・＜オランダガラシ＞・タネツケバナ・ハマダイコン・＜マメグンバイナズナ＞
クスノキ
アケビ
ウマノアシガタ・キツネノボタン
＜スイレン＞
ウシハコベ・コハコベ・ツメクサ・ミドリハコベ・ミミナグサ
イヌビユ・ヒカゲノイノコズチ・ヒナタノイノコズチ・＜ホナガイヌビユ＞・ミズヒキ
＜アレチギシギシ＞・イタドリ・イヌタデ・オオイヌタデ・ギシギシ・ソバ・ツルソバ・ミゾソバ
アケボノアオイ
カラムシ・メヤブマオ
イヌビワ・カナムグラ・クワクサ
アラカシ
ドクダミ
ハナミョウガ
カキツバタ・＜ニワゼキショウ＞・ハナショウブ
ジャノヒゲ・ヤブラン
イ・クサイ・コウガイゼキショウ
コナギ・＜ホテイアオイ＞
ツユクサ・マルバツユクサ
アオウキクサ
ショウブ・セキショウ・マムシグサ・ムサシアブミ
アキカサスゲ・イヌクグ・ハマスゲ・ヒメクグ
イチゴツナギ・イネ・エノコログサ・ギョウギシバ・クサヨシ・チヂミザサ・カモジクサ・＜シマスズメノヒエ＞・ジュズダマ・＜セイバンモロコシ＞・チゴザサ・ニワホコリ・ヒエガエリ・＜ヒメコバンソウ＞・メヒシバ
＜オオカナダモ＞・クロモ
オモダカ
エビモ・ヒルムシロ
ガマ・コガマ・ヒメガマ
スギナ
ホシダ